Actualmente, las inferiores del club se encuentran disputando el Torneo de AFA desde 2012, teniendo un debut importante en aquel año, camiseta uruguay mundial 2022 cuando logró clasificar a la Zona Campeonato (fase final para luchar por el título) siendo ese el primer año de competencia profesional y nacional para las divisiones del «semillero» bodeguero. Torneo Internacional Velasanito (2 tìtulos, Cat. Godoy Cruz ha tenido más de 75 entrenadores desde su fundación, de los cuales la gran parte fueron figuras del club y solo una minoría del ámbito nacional.
